雷州黑鴨PID1基因部分序列的克隆與蛋白功能分析

作  者 黃漢光,湯綺明,蘇瑛,許沖,崔紅艷,常羽,黃駿騰
第一作者 黃漢光
作者單位 廣東海洋大學農學院,廣東湛江
卷  號 43
發表年份 2015
發表刊期 34
發表頁面 207-210
關  鍵  字 雷州黑鴨;PID1;克隆;蛋白功能分析,
摘  要 [目的]了解雷州黑鴨磷酸酪氨酸互作結構域1(phosphotyrosine interaction domain containing 1,PID 1)基因的序列結構特征及其蛋白的功能,為利用其改善雷州黑鴨肉品質與提高肉風味提供分子理論依據。[方法]采用RTPCR方法克隆雷州黑鴨PID1基因部分序列,測序后比對其同源性,構建系統發育樹,并預測其蛋白結構與功能。[結果]該核苷酸序列長度為369 bp,編碼80個氨基酸,且大多為疏水性氨基酸。與人、牛、雞等物種進行同源性比對,發現雷州黑鴨PID1基因序列與雞具有高度同源性,同源性高達94%,且雷州黑鴨與雞聚于同一系統發育支。蛋白質結構預測表明,該蛋白無跨膜結構與信號肽,氨基酸序列呈疏水性,位于細胞質中。[結論]雷州黑鴨的PID1基因與雞的親緣關系最近,其蛋白主要功能是在細胞質中參與肌內脂肪沉積的調控。
附  件 雷州黑鴨PID1基因部分序列的克隆與蛋白功能分析
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