2022年01期

棉鈴蟲CCE001a蛋白結構與功能的生物信息學分析

作  者 張莉,王海亮,馬雪兒,牛俊麗,陳程,張文舉
第一作者 張莉
作者單位 石河子大學動物科技學院,新疆石河子
卷  號 50
發表年份 2022
發表刊期 1
發表頁面 102-105
關  鍵  字 CCE001a;羧酸酯酶;解毒;蛋白質修飾位點;生物信息
摘  要 [目的]深入預測CCE001a蛋白結構與生物學功能。[方法]使用生物信息學方法預測CCE001a基因所編碼的蛋白質,預測其功能與結構。[結果]該蛋白的總氨基酸殘基數為556個,分子式為C2865H4321N737O811S23,蛋白的等電點pI為5.32,帶正電的氨基酸殘基(Arg+Lys)為58 個,帶負電的氨基酸殘基(Asp+Glu)為75個,蛋白不穩定系數為35.22,脂肪系數為75.91,總平均親水性系數為-0.262;CCE001a蛋白有一個脫氫酶超家族(cl21494)結構域;經分析顯示,α-螺旋、無規律的卷曲是這種蛋白質的主要二次結構,分別占31.35%和46.49%,還包括3.96%的β-轉角和18.20%的擴展延伸鏈。經過三級結構學預測表明,該蛋白包括α-螺旋、β-轉角;該蛋白亞細胞被確認為定位在內質網內,存在著信號肽的序列,初步可以認為是具有分泌力的親水蛋白,且沒有出現跨膜蛋白,共有37個磷酸化位點,1個N-糖基化位點。[結論]該研究可為研究CCE001a的解毒機制提供理論基礎。
附  件 棉鈴蟲CCE001a蛋白結構與功能的生物信息學分析
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