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2018年33期
2016—2017年我國部分地區白斑綜合征病毒wsv006的變異分析
| 作 者 | 蔡苗,劉慶慧,萬曉媛,黃倢 |
| 第一作者 | 蔡苗 |
| 作者單位 | 中國水產科學研究院黃海水產研究所，山東青島 |
| 卷 號 | 46 |
| 發表年份 | 2018 |
| 發表刊期 | 33 |
| 發表頁面 | 75-79,103 |
| 關 鍵 字 | WSSV；wsv006；變異, |
| 摘 要 | ［目的］了解wsv006蛋白結構變異情況，并進一步為其蛋白功能研究提供參考資料。［方法］以2016和2017年在全國18個地區采集的WSSV陽性樣品為模板，采用PCR方法，用特異性引物擴增wsv006基因，經連接轉化后進行測序，并對測序結果進行分析。［結果］在2016年的47 份樣本中有9個樣本，包括河北黃驊、山東日照、河北滄州和河北唐山4個地區的樣本中出現了wsv006目的條帶，檢出率為19%。在2017年的39 份 WSSV 陽性樣本中有16個樣本，包括福建霞美鎮、河北黃驊、廣東湛江、山東濱州、山東東營和上海6個地區的樣本中出現了wsv006的目的條帶，檢出率為41%。氨基酸序列比對結果顯示，擴增的wsv006編碼氨基酸變異包括氨基酸替換、插入、缺失和提前終止翻譯，其中插入的主要是脯氨酸（P）和蘇氨酸（T），插入位點在第151~166位，處于PT的交叉重復區域；終止翻譯是由于核苷酸第541位插入了GAGG，在轉錄過程中形成了終止密碼子。［結論］wsv006氨基酸序列存在明顯變異。 |
| 附 件 |
2016—2017年我國部分地區白斑綜合征病毒wsv006的變異分析
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