2017年29期

黃芪甲基化敏感擴增多態性(MSAP)擴增引物篩選及初步應用

作  者 宗凱,趙營莉,周莉質,李秀秀,宮鵬,夏泉
第一作者 宗凱
作者單位 安徽出入境檢驗檢疫局,安徽合肥
卷  號 45
發表年份 2017
發表刊期 29
發表頁面 149-152
關  鍵  字 黃芪;甲基化敏感擴增多態性;選擇性擴增;聚類分析,
摘  要 [目的]建立并優化黃芪甲基化敏感擴增多態性(MSAP)技術擴增反應體系,對中藥材黃芪甲基化水平進行研究。[方法]磁珠法提取黃芪DNA后,采用Hpa II/Msp I 2種內切酶進行酶切,將酶切產物加上連接接頭序列,經預擴增和選擇性擴增反應,最終從黃芪 MSAP的256對引物中篩選出最佳分辨引物4對。應用篩選到的4對引物,分析12種不同產地黃芪的甲基化模式,并對甲基化水平聚類分析。[結果]經MSAP檢測12個黃芪樣本半甲基化率在12.5%~26.7%,全甲基化率在25.6%~51.1%,總甲基化率在48.7%~735%,總體上黃芪樣本的全甲基化率大于半甲基化率。采用NTSYSpc軟件對黃芪樣品Hpa II和Msp I多態性數據進行分析,獲得UPGMA聚類圖和主成分分析PCA圖。[結論]MSAP技術能夠很好地用于黃芪的甲基化分析,結合NTSYSpc軟件能對不同產地黃芪之間甲基化水平進行聚類分析,且初步分析結果表明從UPGMA和PCA圖上來看,地區相近的單株聚類分析表現出了一定的地域性。
附  件 黃芪甲基化敏感擴增多態性(MSAP)擴增引物篩選及初步應用
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