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2017年12期
青春雙歧桿菌ATCC15703 I型Sec途徑分泌蛋白的預測和功能分析
| 作 者 | 朱德全，周金影，張躍華，張武 |
| 第一作者 | 朱德全 |
| 作者單位 | 佳木斯大學理學院，黑龍江佳木斯 |
| 卷 號 | 45 |
| 發表年份 | 2017 |
| 發表刊期 | 12 |
| 發表頁面 | 136-138，143 |
| 關 鍵 字 | 青春雙歧桿菌；基因組；分泌蛋白；Sec分泌途徑；信號肽, |
| 摘 要 | ［目的］對青春雙歧桿菌分泌蛋白進行預測和功能分析，為分析該菌胞外蛋白的分泌機制和功能打下基礎。［方法］以青春雙歧桿菌代表菌株ATCC15703基因組編碼蛋白序列為研究對象，采用 SignalP 4.0和TMHMM 2.0 軟件分析該菌株的I型Sec途徑分泌蛋白，同時采用COG功能數據庫（Cluster of Orthologous Groups of proteins）對預測的這類分泌蛋白進行功能分析。［結果］青春雙歧桿菌ATCC15703的1 648個蛋白中有91個被I 型（Spase I）信號肽酶識別的I型Sec途徑分泌蛋白，分泌蛋白的信號肽長度最大的有54個氨基酸，最小的有11個氨基酸。I 型Sec途徑分泌蛋白的功能分析結果顯示，分泌蛋白主要參與碳水化合物代謝與轉運，氨基酸代謝與轉運，復制、重組和修復，以及無機離子代謝和轉運。［結論］青春雙歧桿菌I型Sec途徑分泌蛋白的預測和功能分析為了解該菌胞外蛋白的分泌機制提供了數據基礎。 |
| 附 件 |
青春雙歧桿菌ATCC15703 I型Sec途徑分泌蛋白的預測和功能分析
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