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2017年11期
動物雙歧桿菌AD011表面脂蛋白的全基因組預測和功能分析
| 作 者 | 栗金柳，王茗悅，朱德全，高峰，于陸雪子，周金影，郝瑩瑩，張宛麟，周博 |
| 第一作者 | 栗金柳 |
| 作者單位 | 佳木斯大學生命科學學院，黑龍江佳木斯 |
| 卷 號 | 45 |
| 發表年份 | 2017 |
| 發表刊期 | 11 |
| 發表頁面 | 117-118 |
| 關 鍵 字 | 動物雙歧桿菌；基因組；脂蛋白；信號肽, |
| 摘 要 | ［目的］運用生物信息學方法預測動物雙歧桿菌AD011定位于細胞膜的表面脂蛋白，為后續研究該菌與宿主相互作用的分子機制提供基礎資料。［方法］用SignalP 4.0和LipoP軟件對動物雙歧桿菌AD011全基因組編碼蛋白中表面脂蛋白和信號肽進行預測，同時采用COG 功能數據庫對預測的脂蛋白進行功能注釋和聚類分析。［結果］對動物雙歧桿菌AD011基因組1 518個蛋白的表面脂蛋白預測，結果表明，19個蛋白具有脂蛋白信號肽。功能分析顯示，該菌株19個脂蛋白中有3個蛋白沒有功能注釋，16個蛋白有功能注釋，其中10個蛋白參與氨基酸代謝與轉運、3個蛋白參與碳水化合物代謝與轉運，3個蛋白參與無機鹽離子代謝與轉運。［結論］動物雙歧桿菌AD011表面脂蛋白參與的功能主要與營養物質的轉運和代謝有關。 |
| 附 件 |
動物雙歧桿菌AD011表面脂蛋白的全基因組預測和功能分析
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