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2016年20期
長雙歧桿菌NCC2705分泌蛋白的全基因組預測和功能分析
| 作 者 | 朱德全，王茗悅，栗金柳，孟祥晨，程廣東，岳麗紅，王長平，薛勇 |
| 第一作者 | 朱德全 |
| 作者單位 | 佳木斯大學生命科學學院，黑龍江佳木斯 |
| 卷 號 | 44 |
| 發表年份 | 2016 |
| 發表刊期 | 20 |
| 發表頁面 | 109-111，130 |
| 關 鍵 字 | 長雙歧桿菌；基因組；分泌蛋白；分泌途徑；信號肽, |
| 摘 要 | 以長雙歧桿菌NCC2705基因組序列為研究對象，使用 SignalP 4.0、LipoP 、TMHMM 2.0 軟件分析該基因組中的分泌蛋白及其信號肽的類型，同時采用COG (Cluster of Orthologous Groups of proteins)功能數據庫對預測的分泌蛋白進行功能注釋和聚類分析。結果表明，長雙岐桿菌NCC2705 中共有37個Sec 途徑分泌蛋白，其中Sec 途徑分泌蛋白包括27個被I 型（SPase Ⅰ）信號肽酶和10個 Ⅱ 型信號肽酶（SpaseII）識別的蛋白，Sec 途徑分泌蛋白信號肽長度最多的有52 個氨基酸，最少的有10個氨基酸。分泌蛋白的功能分析表明，該菌株分泌蛋白中含有大部分的假定蛋白，主要參與氨基酸代謝與轉運、碳水化合物代謝轉運，無機鹽離子代謝轉運，細胞壁和細胞膜生物合成的功能有關。 |
| 附 件 |
長雙歧桿菌NCC2705分泌蛋白的全基因組預測和功能分析
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