2016年14期

福建地區2株豬嵴病毒VP1基因的克隆及遺傳進化分析

作  者 張永軍,胡永浩
第一作者 張永軍
作者單位 中農威特生物科技股份有限公司,甘肅蘭州
卷  號 44
發表年份 2016
發表刊期 14
發表頁面 149-151
關  鍵  字 豬嵴病毒;VP1基因;同源性,
摘  要 [目的]調查豬嵴病毒在福建地區腹瀉豬群中的流行和變異情況。[方法]根據GenBank中登陸的豬嵴病毒(porcine kobuvirus,PKoV)結構蛋白VP1基因序列設計特異性引物,采用RT-PCR方法從某豬場采集腹瀉小腸樣品中擴增豬嵴病毒VP1基因,將擴增后的目的片段克隆后進行序列測定。應用生物信息學軟件,將獲得的2株豬嵴病毒VP1和GenBank的豬嵴病毒株VP1基因序列進行對比分析。[結果]豬嵴病毒CH/FJNP/12L/2015與匈牙利株K-30-HU/2008/HUN(GQ249161)的核苷酸同源性最高,為88.1%,氨基酸同源性為95.3%。 CH/FJNP/12W1/2015與越南株714441/CAOLANH-VH/2012-2-21(KT266058)的核苷酸同源性最高,為88.2%,氨基酸同源性為96.1%,同源重組分析顯示,2株毒株均無明顯同源重組發生。[結論]頻繁的畜禽國際貿易,以及如今便捷的現代化交通工具,人們生活提供方便的同時,也加速了豬嵴病毒毒性的傳播。
附  件 福建地區2株豬嵴病毒VP1基因的克隆及遺傳進化分析
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