2016年12期

弗氏鏈霉菌tylF基因的克隆及其生物信息學分析

作  者 閆明亮
第一作者 閆明亮
作者單位 中國人民解放軍海軍工程大學電氣工程學院,湖北武漢
卷  號 44
發表年份 2016
發表刊期 12
發表頁面 126-129,149
關  鍵  字 tylF;泰樂菌素;弗氏鏈霉菌;基因克隆,
摘  要 [目的]研究弗氏鏈霉菌tylF基因的克隆及其生物信息學分析。[方法]利用RT-PCR技術、巢式PCR技術和RACE技術從弗氏鏈霉菌B-62169菌株中克隆獲得tylF基因的全長cDNA序列,并對其生物信息學進行分析。[結果]經Vector NTI 11.0軟件拼接獲得tylF基因全長cDNA序列長度為1 245 bp,并帶有19 bp長的Poly(A)尾巴,包含927 bp的開放讀碼框(ORF),編碼一個含309個氨基酸殘基的蛋白質。生物信息學分析結果表明,tylF基因編碼的酶是大菌素-O-甲基轉移酶,參與分子功能中甲基轉移酶活性和生物學途徑中甲基化過程。對tylF基因全長cDNA序列進行蛋白質結構域分析,證實該基因編碼TylF蛋白,并具有223個氨基酸蛋白結構域。[結論]該研究為闡明泰樂菌素生物合成過程中甲基化反應機理,更進一步研究大環內酯類抗生素生物合成代謝途徑提供生物信息學數據支持。
附  件 弗氏鏈霉菌tylF基因的克隆及其生物信息學分析
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