2016年09期

獺兔酪氨酸酶相關蛋白1(Tyrp1)基因序列分析及外顯子多態性研究

作  者 郝曄,施麗娟,閆曉榮,趙博昊,朱杰,陳陽,翁巧琴,吳信生
第一作者 郝曄
作者單位 揚州大學動物科學與技術學院,江蘇揚州
卷  號 44
發表年份 2016
發表刊期 9
發表頁面 164-167,196
關  鍵  字 獺兔;Tyrp1;SNPs;序列分析,
摘  要 [目的]探索獺兔酪氨酸相關蛋白1(Tyrp1)基因在毛色形成過程中的分子機制。[方法]對獺兔Tyrp1基因序列的核苷酸序列、編碼產物的基本理化性質等進行預測和分析,同時利用PCRSSCP(Single strand conformation polymorphism analysis of polymerase chain reaction products)技術檢測Tyrp1基因CDS序列的多態性分布狀況。[結果]信息學分析發現,TYRP1蛋白是不穩定的親水性蛋白,有信號肽,具有酪氨酸酶家族特征性功能結構域。多態性檢測發現僅在Tyrp1基因CDS的483 bp處存在1個C→T的同義突變,位于外顯子2上,該堿基的突變沒有造成氨基酸的改變(AUC→AUT,異亮氨酸)。HardyWeinberg 平衡檢驗表明,青紫藍色獺兔群體處于非平衡狀態,白色獺兔群體處于平衡狀態。青紫藍兔群體為中度多態信息含量(0.25<PIC<0.50),白色獺兔群體為低度多態信息含量(PIC<025)。[結論]Tyrp1基因對獺兔的毛色有一定的影響。該研究結果可為獺兔毛色的選種選育提供一定的參考。
附  件 獺兔酪氨酸酶相關蛋白1(Tyrp1)基因序列分析及外顯子多態性研究
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