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2015年31期
水稻ARAB1類似基因的電子克隆及生物信息學分析
| 作 者 | 鮑思元,劉衛東,李冬波 |
| 第一作者 | 鮑思元 |
| 作者單位 | 湖北科技學院基礎醫學院,湖北咸寧 |
| 卷 號 | 43 |
| 發表年份 | 2015 |
| 發表刊期 | 31 |
| 發表頁面 | 38-44 |
| 關 鍵 字 | 水稻；脂肪酶；生物信息學；氨基酸序列；OsARAB1基因 |
| 摘 要 |
［目的］對水稻OsARAB1基因進行電子克隆，并對其進行生物信息學分析。［方法］以NP 174188.1為查詢探針，通過電子克隆獲得OsARAB1基因全長cDNA，用生物信息學軟件對其核苷酸序列和蛋白質序列進行生物信息學分析。［結果］獲得了OsARAB1基因全長cDNA，基因編碼區序列（CDS）全長1 086 bp。電子定位于第五染色體基因組序列NC 008398.2核苷酸序列6 769 813~6 773 213 bp區域。OsARAB1蛋白屬于親水性的胞外蛋白，比較穩定，偏堿性。二級結構以α螺旋和無規則卷曲為主。具有2個功能結構域：SGNH水解酶型酯酶、GDSL脂肪酶。有21個磷酸化位點、7個糖基化位點。推定的活性位點的氨基酸殘基為Ser34、Gly107、Asn167、Asp333、His336。與玉米酯酶亞型B4FM12親緣關系最近。OsARAB1基因的表達對水稻的發育和形態發生起重要作用，與水稻抗稻瘟病有關。［結論］該研究為用試驗方法克隆該基因和功能鑒定奠定了基礎。 |
| 附 件 |
水稻ARAB1類似基因的電子克隆及生物信息學分析
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