大豆基因組保守序列及綜合保守序列擴增多態性分子標記(ICSAP)的設計

作  者 詹少華, 韋傳寶
第一作者 詹少華
作者單位 皖西學院生物與制藥工程學院, 安徽六安
卷  號 41
發表年份 2013
發表刊期 36
發表頁面 13847-13850
關  鍵  字 大豆; 基因組勘探序列; 保守序列; 綜合保守序列; 綜合保守序列擴增多態性
摘  要

 采用VBA程序查找了大豆基因組保守序列——在基因組中出現次數較多的堿基序列片段,分析了這類保守序列的基本特性,在此基礎上,設計了一種新型分子標記——綜合保守序列擴增多態性分子標記。堿基數目越多,保守序列種類數和出現次數越少,從10個堿基到27個堿基,保守序列的GC含量先是逐漸增加,達到一個平臺后又逐漸降低。堿基離保守序列3’端越近,出現A或T的可能性越大,堿基在保守序列中的分布具有非隨機性。不同長度的保守序列具有明顯的進化關系。篩選出10個堿基的保守序列和長度為8個堿基的填充序列用來設計引物,共得到566對引物組合。該新型分子標記有望在條帶多態性、引物一致性等方面超越現有分子標記,同時具有成本低廉等優點。該研究旨在為基因組保守序列查找和分子標記設計方面提供新的思路,分析這些保守序列特性有助于進一步探索分子進化機理。該新型分子標記有可能在大豆種質資源鑒定和基因圖位克隆等方面得到應用,同時該分析方法也適用對其他物種。

附  件 大豆基因組保守序列及綜合保守序列擴增多態性分子標記(ICSAP)的設計
注:若需下載,請右鍵單擊另存
點擊關閉

在線客服

服務熱線:0551-65160973

二維碼

m www