百日草幾丁質酶基因片段克隆及其序列分析

作  者 張振魯,張佳詩,隋麗,李啟云,王金剛,盛巖,杜茜,汪洋洲
第一作者 張振魯
作者單位 中國人民大學環境學院,北京
卷  號 41
發表年份 2013
發表刊期 25
發表頁面 10256-10258,10398
關  鍵  字 百日草;幾丁質酶基因;克隆;序列分析
摘  要

 [目的]克隆百日草幾丁質酶的基因片段,并對其序列進行分析。[方法]以百日草“夢境”系列為材料,提取其葉片總RNA,并根據其他植物幾丁質酶基因保守序列設計簡并引物,通過RTPCR克隆百日草幾丁質酶基因片段(ZEchi),并對該基因序列進行分析。[結果]克隆得到的片段長度為227 bp,共編碼75個氨基酸殘基;核苷酸同源性分析表明,ZEchi與已報道的其他植物幾丁質酶基因同源性達70%以上,其中與葡萄的同源性最高,為74%;氨基酸同源性分析表明,該幾丁質酶多肽屬于18家族幾丁質酶,且與已報道的其他植物幾丁質酶氨基酸序列具有70%以上的相似性;氨基酸聚類分析表明,該幾丁質酶多肽與白車軸草和蒺藜苜蓿的幾丁質酶聚類;生物信息學分析表明,由該基因片段編碼的多肽為非跨膜蛋白,主要含α螺旋和隨機線圈螺旋等二級結構。[結論]該研究為進一步研究幾丁質酶基因的功能奠定了基礎。

附  件 百日草幾丁質酶基因片段克隆及其序列分析
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