水曲柳結構域重新甲基化酶DRM基因片段的克隆及同源性分析

作  者 曾凡鎖,梁楠松,王璇,詹亞光
第一作者 曾凡鎖
作者單位 東北林業大學生命科學學院,黑龍江哈爾濱
卷  號 41
發表年份 2013
發表刊期 24
發表頁面 9934-9937,9950
關  鍵  字 水曲柳;FmadrmA;基因克隆;序列分析
摘  要

 [目的]克隆并分析水曲柳結構域重新甲基化酶(DRM)基因片段。[方法]根據GenBank上已發表的DRM氨基酸序列,采取CODEHOP方法設計合成1對簡并引物,采用RTPCR技術對水曲柳DRM基因進行擴增,將PCR產物與pMD 18T連接后轉化至E.coli JM109感受態細胞,檢測陽性克隆,測序并進行序列分析。[結果]克隆得到的DRM基因cDNA序列長802 bp,由267個氨基酸殘基組成,命名為FmadrmA。序列比對表明FmadrmA與參考的12個物種的DRM在氨基酸水平上表現出較高的同源性,其與山葡萄、番茄、黃瓜、野草莓、大豆、苜蓿、玉米、煙草、擬南芥、毛果楊、水稻和烏拉爾圖小麥的DRM同源性分別為61%、54%、51%、50%、60%、48%、43%、44%、37%、42%、42%和39%。系統進化樹分析表明同源的DRM蛋白可大致聚為3類,而水曲柳與其他植物的親緣關系較遠。[結論]該試驗成功獲得了水曲柳FmadrmA基因片段,并對其進行了同源性分析,為進一步研究結構域重新甲基化酶基因及分析其表達特性奠定了基礎。

附  件 水曲柳結構域重新甲基化酶DRM基因片段的克隆及同源性分析
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