基因組轉座子鑒別與注釋方法研究進展

作  者 靳佩,解增言,蔡應繁,舒坤賢,黃飛飛
第一作者 靳佩
作者單位 重慶郵電大學計算機科學與技術學院,重慶
卷  號 41
發表年份 2013
發表刊期 8
發表頁面 3294-3296,3361
關  鍵  字 轉座子;鑒別;注釋;隱馬爾柯夫模型;同源性;結構特征
摘  要 轉座子是一類可以在基因組不同位置間移動的、重復的序列,廣泛存在于真核和原核生物基因組中,并對基因組的結構、功能和進化有著重要影響。轉座子鑒別與注釋是基因組注釋工作的重要一步,相關軟件可分為3類:從頭算法、基于同源性的算法和聯合算法,不同的軟件實現方法和功能各不相同,并各有優缺點。文中對此進行了綜述,并提出在今后的開發中將會出現更多結合多種算法的綜合流程程序包,它們整合多種方法的優點,針對性強,可根據不同的需求來解決實際問題。
附  件 基因組轉座子鑒別與注釋方法研究進展
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