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2023年01期
基于轉錄組技術的楓葉鮭親本鑒定和雜交優勢分析
| 作 者 | 劉玉猛，蔣潔蘭，毛明光，朱詩裕，王偉 |
| 第一作者 | 劉玉猛 |
| 作者單位 | 大連海洋大學海洋科技與環境學院，遼寧大連 |
| 卷 號 | 51 |
| 發表年份 | 2023 |
| 發表刊期 | 1 |
| 發表頁面 | 98-103, 106 |
| 關 鍵 字 | 楓葉鮭；轉錄組；親本鑒定；抗病優勢分析 |
| 摘 要 | 為探究楓葉鮭的親本來源及雜種抗病優勢，采用Illumina高通量測序技術對楓葉鮭的胸腺和頭腎組織轉錄組進行測序分析。結果獲得胸腺組織原始數據8 224 345 800 bp，拼接獲得169 204條單基因序列(Unigene)；頭腎組織原始數據7 409 864 400 bp，拼接獲得132 292條Unigene。利用生物信息學方法對Unigene進行NR庫相似搜索，還進行了GO、KOG和 KEGG分類注釋。通過比對線粒體DNA（mtDNA）基因序列發現，楓葉鮭與虹鱒（Oncorhynchus mykiss）的線粒體基因同源性達99%以上，可判定楓葉鮭母本是虹鱒；E3、TNF-α、IGM等基因的同源性在大鱗大麻哈魚（Oncorhynchus tshawytscha）中比虹鱒高，推測楓葉鮭父本可能是大鱗大麻哈魚。對免疫相關基因分析發現，IgM、TNF-α和T、B淋巴細胞相關基因序列與父、母本同源性均較高，因此初步判定楓葉鮭抗病優勢是父、母本雙方雜交的結果。通過轉錄組分析雜交種的抗病優勢存在盲區，但該技術可以快速判斷父、母本的來源，獲得大量遺傳信息，優勢明顯。 |
| 附 件 |
基于轉錄組技術的楓葉鮭親本鑒定和雜交優勢分析
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