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2022年03期
2種羌活藥用植物的葉綠體基因組密碼子使用偏性分析
| 作 者 | 王琳璇，王高烽，谷威，趙志敏，馬永貴 |
| 第一作者 | 王琳璇 |
| 作者單位 | 青海師范大學生命科學學院，青海西寧 |
| 卷 號 | 50 |
| 發表年份 | 2022 |
| 發表刊期 | 3 |
| 發表頁面 | 95-101 |
| 關 鍵 字 | 羌活；寬葉羌活；葉綠體基因組；密碼子使用偏性；最優密碼子 |
| 摘 要 | 對羌活（Notopterygium incisum）與寬葉羌活（N.franchetii）的葉綠體編碼基因的密碼子使用偏性（codon usage bias）及其影響因素進行了分析。結果表明：羌活和寬葉羌活的葉綠體基因組總ENC值分別為49.79和49.70，偏性較弱，密碼子第3位堿基傾向于使用A/T。PR2-plot分析表明，選擇壓力和突變都是影響2種羌活葉綠體密碼子使用偏性的主要因素；而中性繪圖分析和ENC-plot分析表明選擇壓力是影響2種羌活葉綠體密碼子使用偏性的主要因素。相對同義密碼子使用度（RSCU）分析確定了2種羌活中使用頻率較高的30個高頻密碼子，幾乎都以A或U結尾，只有UUG以G結尾。羌活的最優密碼子9個，寬葉羌活的最優密碼子7個。2種羌活有5個最優密碼子相同，分別是UUG、CAU、CGU、AGU、GGA。該研究結果為后續藥用羌活植物的基因表達、蛋白質翻譯和遺傳育種研究提供了研究依據和基礎數據。 |
| 附 件 |
2種羌活藥用植物的葉綠體基因組密碼子使用偏性分析
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