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2020年08期
紅鰭東方鲀及雜交鲀的腦和腎臟轉錄組比較分析
| 作 者 | 劉福君，保明秀，荊笛，張鈺渤，王盛南，王秀利 |
| 第一作者 | 劉福君 |
| 作者單位 | 大連海洋大學水產與生命學院基因工程實驗室,遼寧大連 |
| 卷 號 | 48 |
| 發表年份 | 2020 |
| 發表刊期 | 8 |
| 發表頁面 | 106-109，128 |
| 關 鍵 字 | 紅鰭東方鲀；轉錄組；高通量測序；功能注釋 |
| 摘 要 | 為探究雜交鲀(紅鰭東方鲀×菊黃東方鲀)與紅鰭東方鲀差異的分子調節機制，利用Illumina高通量測序技術對紅鰭東方鲀及雜交鲀的腦、腎臟樣本組織進行轉錄組測序，篩選差異表達基因。結果表明：通過RNA-seq技術共篩選到2 207個DEGs (腦)和1 823個DEGs (腎臟)。其中在腦組織樣本中有1 068個DEGs表達上調，1 139個DEGs表達下調，腎臟組織樣本中有851個DEGs表達上調，972個DEGs表達下調；通過GO功能分類與KEGG富集分析，將腦組織的差異基因區分為60個功能類別及137個代謝途徑，包括G蛋白偶聯受體信號通路、跨膜轉運、分子功能調節劑、鈣離子結合等；腎臟組織的差異基因被區分為31個功能分類及142個代謝途徑，包括氧化還原酶活性、肽酶活性、蛋白水解、細胞外區域等。該研究探討了雜交鲀與紅鰭東方鲀生長發育差異過程的相關分子調控機制，可為后續相關研究提供初步理論參考與依據。 |
| 附 件 |
紅鰭東方鲀及雜交鲀的腦和腎臟轉錄組比較分析
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