2020年08期

阿拉伯巖芥AP2基因家族的生物信息學分析

作  者 付春,劉曉偉,王玲,江納,楊瑤君
第一作者 付春
作者單位 樂山師范學院,四川樂山
卷  號 48
發表年份 2020
發表刊期 8
發表頁面 114-123
關  鍵  字 阿拉伯巖芥;AP2基因;生物信息學
摘  要 AP2基因作為一種調控植物花發育的功能基因,參與花分生特性建立。利用生物信息學方法對阿拉伯巖芥AP2蛋白的理化性質、高級結構和系統進化關系等進行了詳細的預測和分析。結果表明,除了成員AA40G00375、AA54G00162為穩定蛋白,其余AP2蛋白均為不穩定蛋白,且大多數蛋白定位在細胞核。只有成員AA8G00350屬于分泌蛋白,其余均為非分泌蛋白,且均不屬于跨膜蛋白。磷酸化位點分析表明AP2蛋白的生物功能主要是通過在絲氨酸(Ser)位點進行磷酸化來實現的。AP2蛋白的二級結構以無規則卷曲為主,各個成員的二級結構元件組成含量大小排列順序為無規則卷曲>α-螺旋>延伸鏈>β-轉角。其中14個AP2蛋白成員有2個保守結構域,其余均有1個保守結構域。系統進化樹表明阿拉伯巖芥AP2基因家族與擬南芥、小麥有較近的親緣關系。這些結果可為進一步研究其生物學功能提供一定的參考依據。
附  件 阿拉伯巖芥AP2基因家族的生物信息學分析
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