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2019年12期
水稻WRKY轉錄因子家族的生物信息學分析
| 作 者 | 王鵬洋，曲姍姍，梁 源，付澤元 |
| 第一作者 | 王鵬洋 |
| 作者單位 | 東北林業大學生命科學學院 |
| 卷 號 | 47 |
| 發表年份 | 2019 |
| 發表刊期 | 12 |
| 發表頁面 | 123-126 |
| 關 鍵 字 | 水稻；WRKY轉錄因子；生物信息學；系統進化樹 |
| 摘 要 | ［目的］對水稻WRKY轉錄因子家族成員進行生物信息學分析，為進一步研究水稻WRKY轉錄因子的功能提供依據。［方法］從NCBI網站下載水稻全基因組序列，利用CDD、Blast、MEME、MEGA、ProtParam等在線工具或本地軟件篩選WRKY家族成員，對所得WRKY家族成員的理化性質、系統進化親緣關系、保守元件等項目進行生物信息學分析。［結果］共從水稻基因組中鑒定篩選出65個WRKY家族成員，每一個成員中都具有WRKYGQK的保守元件，除此之外還有一個保守鋅指結構的元件存在。利用MEGA對所得WRKY家族成員進行聚類發現，65個WRKY家族成員可以分為A、B、C、D、E 5類，其中A、B、C、D 4類的親緣關系較近，可以聚為一類；而A類相對親緣關系較遠，認為A類成員可能是長期進化過程中被保留下來的較為原始的一類。［結論］該研究較系統地鑒定了水稻WRKY家族，為進一步研究水稻WRKY轉錄因子功能和互作關系提供參考。 |
| 附 件 |
水稻WRKY轉錄因子家族的生物信息學分析
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