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2019年11期
黃皮葉綠體基因組測序與分析
| 作 者 | 趙志常，高愛平，黃建峰，羅睿雄 |
| 第一作者 | 趙志常 |
| 作者單位 | 中國熱帶農業科學院熱帶作物品種資源研究所/農業部華南作物基因資源與種質創制重點開發實驗室，海南海口 |
| 卷 號 | 47 |
| 發表年份 | 2019 |
| 發表刊期 | 11 |
| 發表頁面 | 115-118 |
| 關 鍵 字 | 黃皮；葉綠體基因組；測序與分析 |
| 摘 要 | ［目的］ 分析黃皮［Clausena lansium （Lour.）Skeels）］葉綠體基因組，為黃皮屬不同種或品種的進化、雜交、演變，以及黃皮不同品種的鑒定等提供技術支持。［方法］使用試劑盒提取了黃皮的葉綠體DNA，通過測序、組裝、注釋獲得了黃皮葉綠體基因組。［結果］黃皮葉綠體基因組全長159 283 bp，其中反相重復序列區（IRs）長53 998 bp，大單拷貝序列區（LSC）和小單拷貝序列區（SSC）長度分別為87 301、 17 983 bp，共注釋126個基因，包括編碼蛋白基因89個，tRNA基因29個和rRNA 基因8個。黃皮葉綠體基因組全序列GC含量387%。對5種蕓香科果樹的全長序列、SSC、LSC、 IRA、 IRB進行比較分析發現，假黃皮的葉綠體全長序列、LSC、IRA 、IRB區域的長度較其他4種果樹長，檸檬的SSC區域長度最長，黃皮的全長序列和SSC區域長度最短。黃皮葉綠體的基因數目和編碼蛋白數目較其他4種果樹多。對20種園藝植物的葉綠體基因組進行分析發現，同一科下面的不同屬植物或同一屬下面的不同種更容易聚為一類。［結論］該研究豐富了熱帶果樹的葉綠體基因組數據庫，為種質資源的合理開發利用提供了依據。 |
| 附 件 |
黃皮葉綠體基因組測序與分析
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