2019年04期

基于GenBank 數據對紅柴胡nrDNA序列ITS2片段的分析

作  者 王鶴,楊娜,徐丹丹,孫明陽,郭宏莉,關鑫,王世聰,王長寶
第一作者 王鶴
作者單位 佳木斯大學理學院,黑龍江佳木斯
卷  號 47
發表年份 2019
發表刊期 4
發表頁面 114-116
關  鍵  字 紅柴胡;ITS2;遺傳距離;發育分析
摘  要 [目的]了解紅柴胡nrDNA序列ITS2片段特征,為中藥柴胡的分子鑒定提供科學依據。 [方法]從GenBank中獲取已公布紅柴胡ITS全長序列38條和ITS2序列3條,利用MEGA6.0 進行多序列比對,分析ITS2片段堿基成分、變異位點、信息位點,計算遺傳距離,并用鄰接法(NJ)構建系統聚類樹。[結果]ITS2片段長度為224~230 bp,共發現14個簡約信息位點,最大遺傳距離0.124,系統樹可明顯分為4組,85.37%的聚為一組。[結論]ITS2在紅柴胡居群中比較保守,可作為DNA barcoding鑒定的片段使用。
附  件 基于GenBank 數據對紅柴胡nrDNA序列ITS2片段的分析
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