作 者 | 朱長保,徐辰峰,李均乾,劉仁梅,孫高寶 |
第一作者 | 朱長保 |
作者單位 | 金湖縣植保植檢站,江蘇淮安 |
卷 號 | 47 |
發表年份 | 2018 |
發表刊期 | 36 |
發表頁面 | 18-20,28 |
關 鍵 字 | 水稻;鹽脅迫;差異基因表達 |
摘 要 | [目的]初步探索水稻耐鹽機制,篩選關鍵基因。 [方法]從公共基因芯片數據庫GEO(Gene Expression Omnibus)搜索有關鹽脅迫下水稻基因表達的數據,利用 TAC(Transcriptome Analysis Console)篩選表達差異基因,對差異基因進行GO(Gene Ontology)富集分析、信號通路富集分析。[結果]在鹽脅迫下,CSR11、PL177兩種耐受型水稻與IR64、VSR156兩種敏感型水稻分別有3 289、1 934、1 806、4 426個基因表達。耐受型水稻中同時上調或下調的基因有288個,敏感型水稻中同時上調或下調的基因有330個。通過生物信息學研究發現,耐受型水稻鹽脅迫主要影響代謝途徑、次級代謝產物合成、轉錄因子等方面。敏感型水稻鹽脅迫影響主要影響脅迫響應、激素轉導、物質代謝等方面。[結論] 利用生物信息學方法能有效篩選目標基因,并可為進一步研究提供依據。 |
附 件 | 鹽脅迫下不同品種水稻的基因表達 |
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